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計算機輔助藥物設計實驗教程

計算機輔助藥物設計實驗教程

定 價:¥52.00

作 者: 羅海彬,張晨 編
出版社: 中山大學出版社
叢編項:
標 簽: 暫缺

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ISBN: 9787306073518 出版時間: 2021-12-01 包裝: 平裝
開本: 16開 頁數: 146 字數:  

內容簡介

  本書共分為五章內容。第一章介紹定量構效關系,并針對選擇性環(huán)氧合酶抑制劑開展三維定量構效關系研究實驗。第二章以******受體酪氨酸激酶抑制劑為例,對基于藥效團模型虛擬篩選進行了詳細的講解。第三章由七個獨立的子實驗組成,內容涵蓋了點群計算、單電能計算、靜電勢表面計算等,以方便讀者熟悉和掌握小分子的多種結構優(yōu)化操作。第四章為分子對接,集中講解了四種常用對接方法的實驗操作,方便讀者掌握不同對接方法的軟件操作和結果分析。第五章以“普瑞巴林”和“MDM2-抑制劑復合物”為研究對象,對分子動力學模擬實驗操作進行講解。

作者簡介

暫缺《計算機輔助藥物設計實驗教程》作者簡介

圖書目錄

第一章 定量構效關系(QSAR)
一、實驗目的
二、實驗要求
三、實驗原理
1 比較分子力場分析方法(CoMFA)
2 比較分子相似性指數分析方法((CoMSIA)
四、實驗內容
1 背景介紹
2 實驗操作
【參考文獻】
第二章 藥效團模型
一、實驗目的
二、實驗要求
三、實驗原理
1 藥效團特征的種類
2 藥效團模型的構建
3 基于藥效團模型藥物設計方法的應用
四、實驗內容
1 背景介紹
2 實驗操作
【參考文獻】
第三章 結構優(yōu)化
一、實驗目的
二、實驗要求
三、實驗原理
四、實驗內容
1 構建化合物并優(yōu)化結構
2 保證水分子的C2v1點群
3 保證Ge6的Dh對稱性計算
4 同分異構體的單點能計算
5 靜電勢表面ESF(Electrostatic potential surfaces)計算
6 觀察分子振動
7 預測紅外光譜和拉曼光譜
第四章 分子對接
一、實驗目的
二、實驗要求
三、實驗原理
四、實驗內容
1 LibDock對接方法及蛋白一配體相互作用的打分評價
2 CDOCKER和對接姿態(tài)分析
3 SYBYL軟件的分子對接模塊Smflex-Dock
4 MOE軟件的分子對接模塊I)ock
5 總結
【參考文獻】
第五章 分子動力學模擬
一、實驗目的
二、實驗要求
三、實驗原理
四、實驗內容
1 普瑞巴林的溶劑化模型及分子動力學模擬
2 MIDM2一抑制劑復合物的分子動力學模擬
【參考文獻】

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