巴西橡膠樹排膠理論基礎和分析技術指南

上篇 排膠理論基礎
第一章 天然橡膠生物合成機制研究進展
一、植物中異戊二烯合成路徑
二、橡膠粒子在天然橡膠合成中的作用
三、線粒體為橡膠烴合成和膠乳再生提供物質和能量保障
四、天然橡膠合成機理研究重要進展——橡膠轉移酶及其復合體
五、基于巴西橡膠樹橡膠粒子離體天然橡膠合成體系
六、人工橡膠粒子構建取得重要進展
七、展望
第二章 排膠過程活性氧產生和清除研究進展
一、死皮引起橡膠樹樹皮結構與蛋白組成變化
二、橡膠樹死皮發(fā)生相關假說
三、死皮防控技術
四、死皮誘導的水分和活性氧機制模型
五、展望
第三章 橡膠樹轉錄調控研究進展
一、轉錄調控的原理簡介
二、橡膠生物合成中的轉錄調控
三、植物MYB轉錄因子的研究進展
四、植物MYB44轉錄因子研究進展
五、MYB44轉錄因子在橡膠樹抗逆研究中的展望
下篇 技術指南
第四章 轉錄因子分析方法及其在橡膠樹排膠機制研究中的應用
一、轉錄因子結構與功能簡介
二、生物信息學分析
三、轉錄因子發(fā)現(xiàn)與鑒定方法
四、互作蛋白與DNA篩選鑒定
五、蛋白質互作的研究方法
六、轉基因功能驗證
七、轉錄調控技術在橡膠樹排膠功能研究中的展望
第五章 橡膠樹MYB轉錄因子克隆、生物信息學和表達分析
一、橡膠樹HbMYBs基因成員結構分析
二、材料處理方法
三、實驗方法
四、結果與分析
五、討論
第六章 橡膠樹膠乳均一化酵母雙雜交cDNA文庫構建
一、材料與方法
二、結果與分析
三、討論
第七章 抗體制備檢測與Western檢測
一、HblMYC3研究背景
二、橡膠樹HbIMYC3多克隆抗體制備和檢測
三、Western蛋白檢測
第八章 ABA信號途徑bZIP轉錄因子的Pull-down分析
一、ABA的抗逆功能
二、GST Pull-down證明體內蛋白互作
第九章 ChiP-seq鑒定轉錄因子目標基因
一、橡膠樹光照樣品的處理
二、ChIP免疫沉淀實驗
三、ChIP文庫構建流程
四、信息分析流程
五、數(shù)據(jù)過濾質控
六、與參考序列比對
七、Peak分析
八、Peak注釋
第十章 轉錄因子蛋白互作分析方法
一、HbSRPP1基因克隆與分析檢測
二、HbSRPPI菌落PCR檢測和陽性克隆鑒定
三、酵母表達載體構建
四、天然橡膠合成關鍵酶酵母表達載體構建
五、基于酵母雙雜交驗證橡膠生物合成關鍵酶互作
六、BiFC技術驗證蛋白互作
七、螢火素酶實驗驗證蛋白互作
第十一章 轉基因擬南芥技術驗證轉錄因子功能
一、遺傳轉化擬南芥驗證基因功能
二、HbMYB44轉基因擬南芥的功能驗證
第十二章 轉錄因子亞細胞定位分析
一、融合表達載體構建
二、HbMYB44亞細胞定位
第十三章 橡膠樹樹皮線粒體提取及相關生理參數(shù)測定
一、橡膠樹線粒體提取及純化
二、線粒體活性相關生理參數(shù)測定
三、橡膠樹樹皮電鏡樣品制備與超微結構觀察
第十四章 橡膠樹樹皮及膠乳中亞細胞組分蛋白質的提取及LC-MS分析
一、蛋白提取方法
二、蛋白質的胰蛋白酶水解
三、用于質譜數(shù)據(jù)檢索的蛋白質數(shù)據(jù)庫的準備及其他數(shù)據(jù)處理
四、蛋白質的免疫學驗證
第十五章 橡膠樹膠乳代謝組分析
一、橡膠樹材料處理
二、膠乳c乳清樣品制備
三、數(shù)據(jù)分析
四、差異代謝物的篩選
五、差異代謝物分析
參考文獻
附錄1 載體和菌株
附錄2 生化試劑及實驗儀器
附錄3 培養(yǎng)基配制
附錄4 試劑配制及物品準備
附錄5 縮略語
項目資助