計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)

第1章 分子模擬的數(shù)學(xué)基礎(chǔ)
1．1 級數(shù)
1．2 積分的概念和方法
第2章 分子模擬的生物信息學(xué)基礎(chǔ)
2．1 序列比對
2．2 序列分析
2．3 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測
2．4 基因芯片技術(shù)
2．5 各種數(shù)據(jù)庫和網(wǎng)絡(luò)資源
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第3章 分子模擬的物理和化學(xué)基礎(chǔ)
3．1 原子間與分子問作用力
3．2 分子力場
3．3 幾種常見的分子力場
3．4 多體問題和有效成對勢能
3．5 溶劑介電質(zhì)模型
3．6 量子化學(xué)計(jì)算的基本原理
3．7 密度泛函理論
參考文獻(xiàn)
第4章 分子模擬基本算法
4．1 統(tǒng)計(jì)力學(xué)基礎(chǔ)
4．2 MonteCarlo模擬
4．3 分子模擬
4．4 從頭算分子動(dòng)力學(xué)簡介
4．5 QM/MM簡介
4．6 能量優(yōu)化算法與過渡態(tài)求解
參考文獻(xiàn)
第5章 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測
5．1 同源模建
5．2 反相折疊方法
5．3 從頭折疊法
5．4 常用的網(wǎng)站
5．5 常用軟件
參考文獻(xiàn)
第6章 藥物設(shè)計(jì)的統(tǒng)計(jì)方法
6．1 早期的探索
6．2 二維定量構(gòu)效關(guān)系
6．3 三維定量構(gòu)效關(guān)系
6．4 更高維定量構(gòu)效關(guān)系
6．5 數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析方法
參考文獻(xiàn)
第7章 藥物設(shè)計(jì)的信息系統(tǒng)
7．1 化學(xué)信息系統(tǒng)
7．2 組合化學(xué)信息管理系統(tǒng)
7．3 生物信息數(shù)據(jù)庫和軟件
7．4 數(shù)據(jù)庫搜索技術(shù)
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第8章 藥物代謝與精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)
8．1 細(xì)胞色素P450 酶簡介
8．2 細(xì)胞色素P450 酶在生物信息學(xué)、功能基因組學(xué)及代謝組學(xué)中的研究
8．3 單核苷酸多態(tài)性與精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)
8．4 人類細(xì)胞色素P450 酶中單核苷酸多態(tài)性的精準(zhǔn)預(yù)測
8．5 單核苷酸多態(tài)性對細(xì)胞色素P450 酶活性的影響
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第9章 藥物組合與多靶標(biāo)藥物設(shè)計(jì)
9．1 化學(xué)相似性系綜法預(yù)測蛋白一配體相互關(guān)系
9．2 基于化學(xué)傾向性的蛋白一配體關(guān)系預(yù)測
9．3 基于藥物作用網(wǎng)絡(luò)和信號通路的藥物對組合研究
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第10章 計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)應(yīng)用實(shí)例
10．1 抗SARS的藥物設(shè)計(jì)
10．2 HIV蛋白酶抑制劑的篩選
10．3 流感病毒神經(jīng)氨酸酶抑制劑的研究
10．4 定量構(gòu)效關(guān)系與嗯唑烷酮抗菌藥物的設(shè)計(jì)
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第11章 花椒素的發(fā)現(xiàn)及其藥理藥效
11．1 阿爾茨海默病與煙堿乙酰膽堿受體
11．2 花椒素的發(fā)現(xiàn)和結(jié)構(gòu)改造
11．3 花椒素抗老年癡呆的研究
11．4 花椒素的安全性
11．5 花椒素對皮膚的抗衰老作用
11．6 小結(jié)
附錄18 個(gè)小分子的結(jié)構(gòu)
參考文獻(xiàn)
索引
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