數(shù)量性狀遺傳分析

前言
第1章 數(shù)量性狀遺傳研究基礎(chǔ)
1．1 遺傳學(xué)基礎(chǔ)及其發(fā)展
1．1．1 質(zhì)量性狀遺傳與經(jīng)典遺傳學(xué)的發(fā)展
1．1．2 數(shù)量性狀遺傳與數(shù)量遺傳學(xué)的發(fā)展
1．1．3 DNA標(biāo)記與現(xiàn)代數(shù)量遺傳學(xué)
1．1．4 數(shù)量遺傳學(xué)在我國(guó)的發(fā)展
1．2 群體遺傳學(xué)基礎(chǔ)及其發(fā)展
1．2．1 孟德?tīng)柸后w遺傳結(jié)構(gòu)的數(shù)學(xué)模型
1．2．2 隨機(jī)交配下理想大孟德?tīng)柸后w的平衡
1．2．3 群體在非隨機(jī)交配下的遺傳效應(yīng)
1．2．4 改變?nèi)后w基因頻率的因素
1．3 統(tǒng)計(jì)學(xué)基礎(chǔ)
1．3．1．正態(tài)分布及其參數(shù)估計(jì)
1．3．2 有限混合正態(tài)分布及其參數(shù)估計(jì)
1．3．3 線性統(tǒng)計(jì)模型基礎(chǔ)
第2章 近交與隨機(jī)交配群體的遺傳分析
2．1．基因型與環(huán)境
2．1．1 表現(xiàn)型值與基因型值
2．1．2 基因型與環(huán)境互作的方差分析
2．2 基因型值分解、基因的平均效應(yīng)和育種值
2．2．1 基因型值的分解
2．2．2 平衡群體中基因的效應(yīng)
2．2．3 平衡群體中個(gè)體的育種值和育種效應(yīng)
2．2．4 育種值和基因型值的關(guān)系
2．3 近交群體數(shù)量性狀的世代均數(shù)分析
2．3．1 世代平均數(shù)的遺傳組成(期望組分)
2．3．2 遺傳參數(shù)估計(jì)與遺傳模型檢驗(yàn)
2．4 近交群體數(shù)量性狀的世代方差分析
2．4．1 不分離世代的方差
2．4．2 分離世代集團(tuán)混種(混養(yǎng))的方差剖分
2．4．3 F1 代連續(xù)自交的分支交配系統(tǒng)方差的逐級(jí)分解
2．4．4 S3、S4世代方差的分解
2．4．5 顯性度
2．4．6 自交選擇的*適世代及分離極限估計(jì)
2．5 連鎖對(duì)世代均數(shù)和方差的影響
2．5．1 加性-顯性遺傳模型下的兩對(duì)與多對(duì)基因連鎖的F2 代遺傳分析
2．5．2 連鎖對(duì)F1 代連續(xù)自交的分支交配系統(tǒng)方差的影響
2．5．3 連鎖不平衡群體
2．6 隨機(jī)交配群體中親屬間的相關(guān)與回歸
2．6．1 隨機(jī)交配平衡群體中親屬遺傳協(xié)方差及其相似性
2．6．2 近親交配群體的近交系數(shù)計(jì)算
2．6．3 親屬協(xié)方差的一般形式
2．6．4 常見(jiàn)親屬協(xié)方差組分中U和r的計(jì)算
第3章 重復(fù)力、遺傳力、相關(guān)及其估計(jì)
3．1 重復(fù)力、遺傳力和相關(guān)的概念
3．1．1 遺傳力(率)和重復(fù)力(率)
3．1．2 表型相關(guān)、遺傳相關(guān)和環(huán)境相關(guān)
3．1．．3 親屬問(wèn)的表型相似性
3．2 重復(fù)力、廣義遺傳力估計(jì)及重復(fù)力的應(yīng)用
3．2．1 單因素遺傳設(shè)計(jì)試驗(yàn)的組內(nèi)相關(guān)估計(jì)方法
3．2．2 重復(fù)力的準(zhǔn)確度及其應(yīng)用
3．3 狹義遺傳力的估計(jì)
3．3．1 用雙親本雜交類型遺傳設(shè)計(jì)估計(jì)遺傳力
3．3．2 用NCI遺傳設(shè)計(jì)試驗(yàn)估計(jì)狹義遺傳力
3．3．3 用NCII遺傳設(shè)計(jì)試驗(yàn)估計(jì)狹義遺傳力
3．3．4 用NCIII遺傳設(shè)計(jì)估計(jì)狹義遺傳力
3．4 多個(gè)數(shù)量性狀的遺傳力和相關(guān)估計(jì)
3．4．1 單因素遺傳設(shè)計(jì)完全隨機(jī)區(qū)組試驗(yàn)估計(jì)方法
3．4．2 NCI遺傳設(shè)計(jì)完全隨機(jī)試驗(yàn)的多性狀遺傳力和相關(guān)估計(jì)
3．5 閾性狀及其重復(fù)力、遺傳力的估計(jì)
3．5．1 閾性狀的重復(fù)力估計(jì)
3．5．2 閾性狀的遺傳力估計(jì)
3．6 遺傳力、重復(fù)力顯著性測(cè)驗(yàn)原理
3．6．1．均方的方差估計(jì)
3．6．2 均方比的方差估計(jì)
3．6．3 常用遺傳設(shè)計(jì)試驗(yàn)中組內(nèi)相關(guān)系數(shù)的假設(shè)檢驗(yàn)
第4章 選擇原理、方法和模型
4．1．選擇的基本原理
4．1．1 選擇及其預(yù)期選擇反應(yīng)
4．1．2 選擇極限與世代選擇效率指數(shù)
4．1．3 世代間隔、單位時(shí)間遺傳進(jìn)展與現(xiàn)實(shí)遺傳力
4．2 單性狀選擇方法
4．2．1 個(gè)體選擇
4．2．2 家系選擇與同胞選擇
4．2．3 家系內(nèi)選擇
4．2．4 合并選擇
4．2．5 幾種選擇方法相對(duì)效率比較
4．3 間接選擇和綜合選擇指數(shù)
4．3．1 間接選擇
4．3．2 多性狀的選擇．綜合選擇指數(shù)
4．3．3 選擇指數(shù)的通徑分析和決策分析
4．3．4 相關(guān)遺傳進(jìn)展分解原理與決定系數(shù)遺傳力
4．4 通用選擇指數(shù)
4．4．1 通用選擇指數(shù)
4．4．2 通用選擇指數(shù)的通徑分析和決策分析
4．5 組合性狀與組合性狀對(duì)分析
4．5．1 約束組合性狀分析
4．5．2 約束組合性狀對(duì)分析及其通徑分析、決策分析
第5章 主基因．多基因遺傳體系分析
5．1 單個(gè)分離世代數(shù)量性狀的分離分析
5．1．1 單個(gè)分離世代表型分布的主要特征
5．1．2 F2 代數(shù)量性狀分離分析模型
5．1．3 回交世代的主基因．多基因混合遺傳分離分析模型
5．1．4 單個(gè)分離世代數(shù)量性狀分離分析的一步法和兩步法
5．2 數(shù)量性狀的多世代聯(lián)合分離分析簡(jiǎn)介
5．3 主基因．多基因數(shù)量性狀的綜合選擇指數(shù)
5．3．1 綜合選擇指數(shù)原理
5．3．2 應(yīng)用舉例
第6章 交配效應(yīng)與配合力分析
6．1 交配效應(yīng)分析
6．1．1 近交衰退
6．1．2 近交導(dǎo)致的群體遺傳方差再分配
6．1．3 雜種優(yōu)勢(shì)
6．1．4 雜交引起的群體遺傳方差再分配
6．1．5 近交、雜交與環(huán)境方差
6．1．6 雜種優(yōu)勢(shì)的機(jī)理
6．2 配合力分析
6．2．1 配合力概念及其方差
6．2．2 配合力估計(jì)的試驗(yàn)設(shè)計(jì)方法
6．2．3 雙列雜交完全隨機(jī)區(qū)組試驗(yàn)的配合力分析
6．2．4 關(guān)于多元雙列雜交的配合力分析
第7章 數(shù)量性狀與分子遺傳學(xué)
7．1．?dāng)?shù)量性狀與遺傳學(xué)
7．1．1 數(shù)量性狀與經(jīng)典遺傳學(xué)
7．1．2 數(shù)量性狀與分子遺傳學(xué)
7．1．3 遺傳標(biāo)記與基因定位
7．2 QTL的初級(jí)定位及其作圖原理
7．2．1 作圖群體的建立
7．2．2 圖譜構(gòu)建的理論基礎(chǔ)
7．3 單標(biāo)記分析法
7．3．1 單標(biāo)計(jì)分析樣本資料表
7．3．2 用重組率，表示的標(biāo)記和QTL基因型頻率表
7．3．3 基于標(biāo)記分組的標(biāo)記和QTL的共分離信息
7．3．4 均值差．方差分析法及參數(shù)估計(jì)
7．3．5 最大似然估計(jì)的EM算法
7．4 區(qū)間作圖法和復(fù)合區(qū)間作圖法
7．4．1 區(qū)間作圖法
7．4．2 復(fù)合區(qū)間作圖法
7．5 數(shù)量性狀的標(biāo)記輔助選擇
7．5．1 標(biāo)記值選擇
7．5．2 指數(shù)選擇
7．5．3 數(shù)量性狀的分子標(biāo)記輔助選擇
7．6 KEGG通路的通徑分析及其決策分析
7．6．1 DIA方法的KEGG通路
7．6．2 KEGG通路DIA影響的通徑分析及其決策分析
7．6．3 細(xì)胞過(guò)程路梯度分析、通徑分析及其決策分析
7．6．4 梯度分析、通徑分析及其決策分析與DIA方法的比較
參考文獻(xiàn)