生物信息學(xué)理論與技術(shù)

第一章 生物信息數(shù)據(jù)庫
第一節(jié) 核酸序列數(shù)據(jù)庫
第二節(jié) 蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫
第三節(jié) 基因組數(shù)據(jù)庫
第四節(jié) 結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫
第五節(jié) 項數(shù)據(jù)庫

第二章 網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建
第一節(jié) Cytoscape簡介
第二節(jié) Cytoscape的安裝
第三節(jié) 創(chuàng)建網(wǎng)絡(luò)
第四節(jié) Cytoscape插件的應(yīng)用
第五節(jié) 可視化工具GeneMANIA

第三章 幼年與老年快速老化小鼠海馬中差異表達(dá)基因譜分析

第四章 成年與老年快速老化小鼠海馬中差異表達(dá)基因譜分析

第五章 miRNA相關(guān)研究
第一節(jié) miRNA簡介及miRNA檢測
第二節(jié) miRNA靶基因預(yù)測
第三節(jié) 基于生物信息學(xué)的miRNA靶基因功能分析

第六章 大鼠脊髓蛋白組生物信息學(xué)分析

第七章 LncRNA數(shù)據(jù)生物信息學(xué)分析
第一節(jié) LncRNA的定義及來源
第二節(jié) LncRNA相關(guān)信息查找
第三節(jié) 大鼠LncRNA全序列查找

第八章 DNA甲基化檢測
第一節(jié) DNA甲基化概述
第二節(jié) DNA甲基化的預(yù)測
第三節(jié) MeDIPPCR檢測eif5a基因在脊髓損傷大鼠腓腸肌的DNA甲基化改變

第九章 如何從已知靶基因預(yù)測與其相互作用的miRNAs
第一節(jié) 用TargetScan預(yù)測調(diào)控BDNF mRNA的miRNAs
第二節(jié) 用miRanda預(yù)測調(diào)控BDNF mRNA的miRNAs
第三節(jié) 用miRDB預(yù)測調(diào)控BDNF mRNA的miRNAs
第四節(jié) 用miRwalk預(yù)測調(diào)控BDNF mRNA的miRNAs
第五節(jié) 根據(jù)需要建立各網(wǎng)站預(yù)測結(jié)果交集
第六節(jié) 預(yù)測中需要注意的問題

第十章 染色質(zhì)免疫共沉淀技術(shù)
第一節(jié) ChIP技術(shù)現(xiàn)狀背景及實驗原理
第二節(jié) ChIP 實驗后續(xù)技術(shù)

第十一章 生物信息學(xué)預(yù)測蛋白質(zhì)相互作用
第一節(jié) 常用的蛋白質(zhì)相互作用及信號傳導(dǎo)相關(guān)數(shù)據(jù)庫
第二節(jié) 常用的蛋白質(zhì)相互作用可視化工具
第三節(jié) 常用的蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫
第四節(jié) 蛋白質(zhì)功能、結(jié)構(gòu)域和蛋白質(zhì)家族有關(guān)的數(shù)據(jù)庫

第十二章 利用生物信息學(xué)設(shè)計PCR引物及探針
第一節(jié) 聚合酶鏈反應(yīng)和熒光定量聚合酶鏈反應(yīng)的原理與方法
第二節(jié) 引物探針設(shè)計的生物信息學(xué)