水產(chǎn)基因組技術(shù)與研究進(jìn)展

第一章 大片段基因組文庫(kù)的構(gòu)建、質(zhì)量鑒定和應(yīng)用
第一節(jié) 大片段基因組文庫(kù)發(fā)展概述
第二節(jié) 大片段基因組文庫(kù)的構(gòu)建
一、HMW DNA的制備
二、HMW DNA部分酶切和片段選擇
三、載體的制備
四、連接和轉(zhuǎn)化
五、克隆的挑取與保存
六、目的克隆的篩選
第三節(jié) 文庫(kù)的質(zhì)量鑒定
一、文庫(kù)插入片段的平均大小和基因組覆蓋率
二、文庫(kù)的空載率、嵌合率和細(xì)胞器DNA污染
三、文庫(kù)的穩(wěn)定性檢測(cè)
第四節(jié) 大片段基因組文庫(kù)的應(yīng)用
一、基因和數(shù)量性狀位點(diǎn)(QTL)的圖位克隆
二、基因組物理圖譜的構(gòu)建
三、全基因組測(cè)序
四、功能基因組分析
五、比較基因組學(xué)研究
第五節(jié) 大片段基因組文庫(kù)在水產(chǎn)生物基因組研究中的應(yīng)用和展望
第二章 物理圖譜構(gòu)建技術(shù)及其在水產(chǎn)生物基因組研究中的應(yīng)用
第一節(jié) 物理圖譜構(gòu)建技術(shù)
一、黏粒文庫(kù)酶切指紋制備
二、BAC文庫(kù)酶切指紋圖譜的制備
三、物理圖譜的裝配
四、物理圖譜的驗(yàn)證策略
第二節(jié) 物理圖譜在基因組學(xué)研究中的應(yīng)用
一、物理圖譜與遺傳圖譜的整合
二、基于物理圖譜的全基因組測(cè)序策略
三、重要基因的圖位克隆
四、基于物理圖譜的比較基因組學(xué)研究
第三節(jié) 物理圖譜構(gòu)建技術(shù)最新進(jìn)展
第四節(jié) 高信息含量BAC酶切指紋圖譜采集實(shí)驗(yàn)流程
一、BAC克隆DNA提取實(shí)驗(yàn)流程
二、HICF技術(shù)流程
第三章 水產(chǎn)生物遺傳作圖
第一節(jié) 作圖群體的選擇
一、親本的選擇
二、分離群體類型的選擇
三、群體大小的選擇
第二節(jié) 干涉和作圖函數(shù)
一、干涉
二、作圖函數(shù)
第三節(jié) F2、BC和DH群體標(biāo)記位點(diǎn)間重組率的估算
一、兩個(gè)標(biāo)記位點(diǎn)間重組率的估算
二、多位點(diǎn)連鎖分析方法和排序
三、基因型分型錯(cuò)誤率及缺失率對(duì)連鎖圖譜的影響
第四節(jié) 遠(yuǎn)緣雜交群體的連鎖分析
一、全同胞家系分離標(biāo)記的特點(diǎn)
二、擬測(cè)交策略
三、構(gòu)建F1群體遺傳連鎖圖譜的統(tǒng)計(jì)分析步驟
四、構(gòu)建F1群體遺傳連鎖圖譜的軟件
第五節(jié) 遺傳圖譜整合
一、分子圖譜之間的整合
二、物理圖譜和連鎖圖譜整合
……
第四章 全基因組測(cè)序：水產(chǎn)生物基因組資源的全面開(kāi)發(fā)
第五章 熒光原位雜交作圖
第六章 系統(tǒng)發(fā)育基因組學(xué)
第七章 比較基因組學(xué)在水產(chǎn)生物基因組學(xué)研究中的應(yīng)用
第八章 轉(zhuǎn)錄組嘗試測(cè)序技術(shù)
第九章 生物芯片與水產(chǎn)生物功能基因組學(xué)研究
第十章 數(shù)字基因表達(dá)譜技術(shù)
第十一章 魚(yú)類免疫功能基因研究
第十二章 非編碼RNA
第十三章 常用分子標(biāo)記
第十四章 分子遺傳與保護(hù)生物學(xué)
第十五章 水產(chǎn)動(dòng)物轉(zhuǎn)基因技術(shù)
第十六章 魚(yú)類轉(zhuǎn)座子介導(dǎo)的轉(zhuǎn)基因和基因捕獲策略