計(jì)算生物學(xué)導(dǎo)論：圖譜，序列和基因組

定　價(jià)：￥68.00

作　者：	（美）M.S.Waterman 著，黃國泰，王天明譯
出版社：	科學(xué)出版社
叢編項(xiàng)：	生物數(shù)學(xué)叢書；5
標(biāo)　簽：	生物科學(xué)的理論與方法

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ISBN：	9787030251565	出版時(shí)間：	2009-08-01	包裝：	平裝
開本：	16開	頁數(shù)：	356	字?jǐn)?shù)：

內(nèi)容簡介

　　《計(jì)算生物學(xué)導(dǎo)論：圖譜、序列和基因組》是Introduction to Computational Biology的中文譯著，《計(jì)算生物學(xué)導(dǎo)論：圖譜、序列和基因組》的意圖是針對有數(shù)學(xué)技能的人介紹令人著迷的生物數(shù)據(jù)和問題，并建立更實(shí)際的生物數(shù)學(xué)的基礎(chǔ)?！队?jì)算生物學(xué)導(dǎo)論：圖譜、序列和基因組》共分15章，其中第1章介紹分子生物學(xué)的基本常識，第2-4章介紹限制圖譜和多重圖譜，第5、6章研究克隆和克隆圖譜，第7章討論DNA序列相關(guān)的話題，第8-11章是共同模式下序列比較問題，第12章涉及序列中模式計(jì)數(shù)的統(tǒng)計(jì)問題，第13章敘述RNA二級結(jié)構(gòu)的數(shù)學(xué)化論述，第14章給出有關(guān)序列的進(jìn)化歷史，最后第15章給出某些關(guān)鍵文獻(xiàn)的原始出處.《計(jì)算生物學(xué)導(dǎo)論：圖譜、序列和基因組》結(jié)構(gòu)完整，內(nèi)容更新、更全面?！队?jì)算生物學(xué)導(dǎo)論：圖譜、序列和基因組》適合高等院校數(shù)學(xué)和生物專業(yè)的高年級大學(xué)生、研究生和教師閱讀參考，也適合科研單位的研究人員參考。

作者簡介

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圖書目錄

《生物數(shù)學(xué)叢書》序
前言
數(shù)學(xué)符號
第0章引言
0.1 分子生物學(xué)
0.2 數(shù)學(xué)，統(tǒng)計(jì)和計(jì)算機(jī)科學(xué)
第1章分子生物學(xué)一些知識
1.1 DNA和蛋白
1.1.1 雙螺旋結(jié)構(gòu)
1.2 中心定理
1.3 遺傳密碼
1.4 轉(zhuǎn)化RNA和蛋白序列
1.5 基因不簡單
1.5.1 開始與停止
1.5.2 基因表達(dá)的控制
1.5.3 割裂基因
1.5.4 跳躍基因
1.6 生物化學(xué)
問題
第2章限制圖譜
2.1 引言
2.2 圖
2.3 區(qū)間圖
2.4 片段大小的度量
問題
第3章多重圖譜
3.1 雙消化問題
3.1.1 雙消化問題的多重解
3.2 多重解分類
3.2.1 反射性
3.2.2 重疊等價(jià)
3.2.3 重疊尺寸等價(jià)
3.2.4 更多的圖論知識
3.2.5 從一條路到另一條路
3.2.6 限制圖譜及邊界塊圖
3.2.7 限制圖譜的盒變換
3.2.8 一個(gè)例子
問題
第4章求解DDP的算法
4.1 算法和復(fù)雜性
4.2 DDP是NP完全的
4.3 解DDP的方法
4.3.1 整數(shù)規(guī)劃
4.3.2 劃分問題
4.3.3 TSP
4.4 模擬退火法：TSP和DDP
4.4.1 模擬退火法
4.4.2 TSP
4.4.3 DDP
4.4.4 環(huán)狀圖譜
4.5 用真實(shí)數(shù)據(jù)作圖
4.5.1 使數(shù)據(jù)符合圖
4.5.2 圖譜算法
問題
第5章克隆與克隆文庫
5.1 有限的隨機(jī)克隆數(shù)
5.2 完全消化的文庫
5.3 部分消化的文庫
5.3.1 可克隆基的組分
5.3.2 采樣、方法
5.3.3 設(shè)計(jì)部分消化文庫
5.3.4 Poisson近似
5.3.5 獲得所有片段
5.3.6 最大表達(dá)度
5.4 每個(gè)微生物中的基因組
問題
第6章物理基因組圖譜：海洋、島嶼和錨
6.1 用指紋制作圖譜
6.1.1 海洋和島嶼
6.1.2 分小與控制
6.1.3 兩個(gè)先驅(qū)實(shí)驗(yàn)
6.1.4 啤酒酵母
6.1.5 大腸桿菌
6.1.6 計(jì)算指紋模式
6.2 用錨制作圖譜
6.2.1 海洋、島和錨
6.2.2 克隆與錨的對偶性
6.3 克隆重疊的概述
6.4 綜合
問題
第7章序列裝配
7.1 鳥槍測序法
7.1.1 SSP是NP完全的
7.1.2 貪婪算法的解至多是4倍最優(yōu)解
7.1.3 實(shí)踐中的裝配
7.1.4 序列精度
7.1.5 預(yù)期的進(jìn)展
7.2 用雜交法測序
7.2.1 其他SBH設(shè)計(jì)
7.3 重訪鳥槍測序法
問題
第8章數(shù)據(jù)庫和快速序列裝配
8.1 DNA和蛋白序列數(shù)據(jù)庫
8.1.1 序列數(shù)據(jù)庫文件中條款的描述
8.1.2 簡單序列數(shù)據(jù)文件
8.1.3 統(tǒng)計(jì)小結(jié)
8.2 序列的樹表現(xiàn)
8.3 序列的切細(xì)
8.3.1 切細(xì)表
8.3.2 用線性時(shí)間切細(xì)
8.3.3 切細(xì)和鏈接
8.4 序列中的重復(fù)
8.5 用切細(xì)進(jìn)行序列比較
8.6 至多有f個(gè)失配的序列比較
8.7 用統(tǒng)計(jì)量進(jìn)行序列比較
問題
第9章動態(tài)規(guī)劃、兩個(gè)序列比對
9.1 比對的個(gè)數(shù)
9.2 網(wǎng)絡(luò)中最短和最長路
9.3 全局距離比對
9.3.1 插入刪除函數(shù)
9.3.2 依賴距離的權(quán)重
9.4 全局相似比對
9.5 將一個(gè)序列吻合另一個(gè)序列
9.6 局部比對和叢
9.6.1 自身比較
9.6.2 銜接重復(fù)
9.7 線性空間算法
9.8 回溯
9.9 倒位
9.1 0圖譜比對
9.1 1參數(shù)序列比較
9.1 1.1 一維參數(shù)集合
9.1 1.2 進(jìn)入二維
問題
第10章多重序列比對
10.1 囊性纖維化基因
10.2 r維的動態(tài)規(guī)劃
10.2.1 減小容積
10.3 加權(quán)平均序列
10.3.1 比對的比對
10.3.2 序列的重心
10.4 輪廓分析
10.4.1 統(tǒng)計(jì)意義
10.5 通過隱Markov模型比對
……
第11章序列比對用到的概率和統(tǒng)計(jì)
第12章有關(guān)序列模式的概率與統(tǒng)計(jì)
第13章 RNA二級結(jié)構(gòu)
第14章樹和序列
第15章來源與展望
參考文獻(xiàn)
附錄問題解答和提示
索引