免疫信息學原理及其應用

第1章　緒論
　1.1　免疫信息學是一門新興交叉學科
　1.2　免疫信息學研究的基本問題
　1.3　免疫信息學研究的基本方法
1.3.1 數(shù)據(jù)庫構建方法
1.3.2　計算與統(tǒng)計學方法
1.3.3　數(shù)學建模與計算機模擬方法
　1.4　免疫信息學的應用
1.4.1 系統(tǒng)免疫學理論與人工智能研究
1.4.2　疫苗研發(fā)與傳染病研究
1.4.3 實驗與臨床免疫學研究
　參考文獻
第2章　免疫生物學基礎
　2.1　免疫應答
2.1.1 天然免疫
2.1.2　適應性免疫
　2.2　免疫系統(tǒng)的組成與結構
2.2.1 免疫器官
2.2.2 免疫細胞
2.2.3 免疫分子
　2.3　免疫系統(tǒng)的機制
2.3.1 抗原
2.3.2 免疫系統(tǒng)的特異性識別
2.3.3 免疫記憶與免疫耐受
　2.4　免疫監(jiān)督
　2.5　免疫效應及其調節(jié)機制
2.5.1 免疫效應
2.5.2 免疫調節(jié)
　2.6　免疫系統(tǒng)的復雜性特征
2.6.1 復雜性適應系統(tǒng)
2.6.2 免疫系統(tǒng)的自組織
2.6.3 免疫系統(tǒng)網絡
　2.7　小結
　參考文獻
第3章　免疫系統(tǒng)功能模建
　3.1　淋巴細胞的免疫識別與增殖動力學
3.1.1 T、B淋巴細胞受體庫大小估計
3.1.2　淋巴細胞增殖與分化的克隆模型
　3.2　獨特型網絡與免疫應答
3.2.1 獨特型網絡與免疫記憶
3.2.2　獨特型網絡與免疫耐受
　3.3　免疫系統(tǒng)的調節(jié)
3.3.1 免疫相關細胞的分子調控網絡
3.3.2 免疫應答的細胞調節(jié)
3.3.3 宿主免疫應答的系統(tǒng)水平的調節(jié)
　3.4　小結
　參考文獻
第4章　免疫信息學數(shù)據(jù)庫和數(shù)據(jù)挖掘
　4.1　數(shù)據(jù)庫概念
　4.2　免疫信息學數(shù)據(jù)庫
4.2.1 簡介
4.2.2　基于網絡的免疫信息學公共數(shù)據(jù)庫利用
4.2.3　免疫多態(tài)性數(shù)據(jù)庫(IPD)
4.2.4 SYFPEITHI
4.2.5 IMTECH免疫信息學數(shù)據(jù)庫
4.2.6 抗原決定簇數(shù)據(jù)庫(IEDB)
　4.3　數(shù)據(jù)挖掘與知識發(fā)現(xiàn)
4.3.1 數(shù)據(jù)挖掘在免疫信息學中的作用
4.3.2 數(shù)據(jù)挖掘在免疫信息學中的應用步驟
4.3.3 短肽預測的數(shù)據(jù)挖掘實例
　參考文獻
第5章　B細胞表位的預測
第6章　T細胞表位的預測
第7章　抗原處理與TAP轉運預測
第8章　感染性疾病的傳播動力學及免疫流行病學模型　
第9章　抗病毒疫苗研究
第10章　反向疫苗學在抗細菌疫苗中的應用
第11章　免疫信息學在抗原蟲病疫苗研發(fā)中的應用
第12章　抗蠕蟲疫苗研發(fā)
第13章　免疫信息學和抗腫瘤疫苗的研發(fā)
第14章　生物信息學在抗自身免疫病疫苗研發(fā)中的應用
第15章　免疫信息學在實驗與臨床免疫學中的應用
附錄A
附錄B