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大豆在暗誘導(dǎo)下光周期及衰老相關(guān)基因的差異表達(dá)研究

大豆在暗誘導(dǎo)下光周期及衰老相關(guān)基因的差異表達(dá)研究

定 價(jià):¥25.00

作 者: 趙琳 著
出版社: 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)技術(shù)出版社
叢編項(xiàng):
標(biāo) 簽: 農(nóng)作物

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ISBN: 9787802338692 出版時(shí)間: 2009-05-01 包裝: 平裝
開(kāi)本: 大32開(kāi) 頁(yè)數(shù): 180 字?jǐn)?shù):  

內(nèi)容簡(jiǎn)介

  《大豆在暗誘導(dǎo)下光周期及衰老相關(guān)基因的差異表達(dá)研究》講述了:黑龍江省是我國(guó)大豆主要生產(chǎn)基地,加入世貿(mào)組織后,大豆面臨嚴(yán)重的進(jìn)口壓力。主要原因是我國(guó)大豆單產(chǎn)低,競(jìng)爭(zhēng)力不強(qiáng)。大豆屬于短日照植物,其生長(zhǎng)發(fā)育對(duì)光周期反應(yīng)非常敏感,這一特性嚴(yán)重阻礙大豆品種的適應(yīng)性,是制約大豆單產(chǎn)提高和穩(wěn)產(chǎn)的關(guān)鍵因素。暗處理相當(dāng)于短日照,可以縮短大豆的開(kāi)花和成熟期,其表型之一是加速葉片的衰老。葉細(xì)胞的結(jié)構(gòu)、代謝和基因表達(dá)都協(xié)調(diào)的發(fā)生變化,細(xì)胞器官的組分被依次有序的分解。代謝變化包括合成代謝活性的減弱,如光合作用和蛋白質(zhì)的合成,以及分解代謝的加速,如核酸降解和蛋白水解。這些對(duì)維持植物生長(zhǎng)和生殖是非常必要的,基因轉(zhuǎn)錄物豐度的巨大變化揭示了從有光合活性的葉片到作為流動(dòng)營(yíng)養(yǎng)物來(lái)源的衰老器官來(lái)維持發(fā)育的轉(zhuǎn)變情況。為了打破大豆種植區(qū)域的局限性,本研究在細(xì)胞分子水平上從基因差異表達(dá)的角度研究短日照光周期誘導(dǎo)開(kāi)花和衰老過(guò)程中基因轉(zhuǎn)錄豐度的變化,克隆與大豆光周期反應(yīng)及衰老有關(guān)的基因,從而探索大豆葉片感受日長(zhǎng)變化誘導(dǎo)開(kāi)花和衰老的復(fù)雜機(jī)制。雖然植物花器官的分化發(fā)生在頂端分生組織,在開(kāi)花過(guò)程中的基因表達(dá)也必然在頂端分生組織中有所反映,然而植物感受光的器官是葉片,并利用長(zhǎng)距離信號(hào)通過(guò)韌皮部傳導(dǎo)至頂端分生組織(SAM)影響生殖生長(zhǎng),在光周期控制開(kāi)花過(guò)程中也必然牽涉葉片中很多基因的互作。由于黑暗的長(zhǎng)度是開(kāi)花時(shí)間的關(guān)鍵決定因素,在光周期控制開(kāi)花過(guò)程中基因可能在夜間表達(dá)有差異,所以,以晝夜交替時(shí)的大豆的兩個(gè)樣本的葉片為研究目的對(duì)象,構(gòu)建了差異表達(dá)的cDNA消減文庫(kù),發(fā)現(xiàn)與暗誘導(dǎo)相關(guān)的差異表達(dá)基因,揭示了有關(guān)參與機(jī)體暗適應(yīng)下蛋白質(zhì)的上調(diào)表達(dá)的信息,為進(jìn)一步分離暗處理產(chǎn)生差異表達(dá)基因奠定了基礎(chǔ)。通過(guò)轉(zhuǎn)化短日照煙草,進(jìn)行光周期反應(yīng)基因的功能驗(yàn)證,分析該類(lèi)基因在光周期反應(yīng)中的作用。同時(shí),研究外源激素的施加對(duì)光周期途徑相關(guān)轉(zhuǎn)錄因子基因表達(dá)的影響;分析開(kāi)花誘導(dǎo)中基因組織特性的表達(dá)情況。本研究的宗旨是通過(guò)基因的克隆和改造,試圖從根本上改變大豆對(duì)光的敏感性,為大豆高產(chǎn)穩(wěn)產(chǎn)提高尋找新的突破口,從根本上扭轉(zhuǎn)我國(guó)大豆依賴(lài)于進(jìn)口的被動(dòng)局面。主要結(jié)果如下。1.本試驗(yàn)首次應(yīng)用抑制性消減雜交(SSH)技術(shù)以東農(nóng)u3大豆的短日照(8h光/16h暗)和長(zhǎng)日照(16h光/8h暗)兩個(gè)樣本為研究目的對(duì)象,構(gòu)建了含有1738個(gè)克隆的差異表達(dá)的cI)NA消減文庫(kù),對(duì)148個(gè)克隆進(jìn)行測(cè)序,在此基礎(chǔ)上發(fā)現(xiàn)了76個(gè)與暗誘導(dǎo)相關(guān)的差異表達(dá)ESTs(上調(diào)至少3倍),根據(jù)Blastn和Blastx推測(cè)這些ESTs的功能包括參與轉(zhuǎn)錄、信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)和細(xì)胞凋亡的調(diào)節(jié)類(lèi)蛋白;參與大分子降解的酶類(lèi)如蛋白和核酸的降解、參與細(xì)胞壁修飾的合成代謝、初級(jí)代謝以及次級(jí)代謝的酶類(lèi)和解毒與防衛(wèi)的壓力反應(yīng)的基因。揭示了有關(guān)參與機(jī)體暗適應(yīng)下蛋白質(zhì)的上調(diào)表達(dá)的信息,為進(jìn)一步分離短日處理產(chǎn)生差異表達(dá)基因奠定了基礎(chǔ)。2.為了研究GmRAV在大豆短日照信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)中的可能作用,我們利用cDNA末端快速擴(kuò)增(RACE)技術(shù)從大豆中克隆了編碼GmRAv的cDNA序列。序列分析結(jié)果表明,GmRAV基因編碼351個(gè)氨基酸,含有AP2/ERF和B3結(jié)構(gòu)域,GenBank登陸號(hào)為DQ147914,其DNA序列與辣椒、水稻和擬南芥RAV基因高度同源。3.Real-time RT-PCR分析在短日照和長(zhǎng)日照條件下大豆葉片中GmRAV基因mRNA轉(zhuǎn)錄物的豐度變化,表明該基因的豐度在短日照(SD)時(shí)都要顯著高于在長(zhǎng)日照(LD)條件下的豐度。4.分析GmRAV基因在不同組織中mRNA轉(zhuǎn)錄物的豐度變化表明,SD強(qiáng)烈誘導(dǎo)GmRAV基因在葉、根和莖中的表達(dá)。5.構(gòu)建了植物表達(dá)載體pBI121-GmRAV,用農(nóng)桿菌介導(dǎo)法轉(zhuǎn)化煙草過(guò)量表達(dá)該基因,獲得卡那霉素抗性植株54株。PCR方法鑒定Tn轉(zhuǎn)基因株系,獲得18個(gè)轉(zhuǎn)基因的PCR陽(yáng)性植株。通過(guò)Northern分析表明這4株轉(zhuǎn)基因煙草中的GmRAV基因都轉(zhuǎn)錄,表明它們都已成功轉(zhuǎn)入煙草中,并正常表達(dá)。6.GmRAV過(guò)量表達(dá)的煙草植株與對(duì)照相比無(wú)論在長(zhǎng)日照和短日照下植株都明顯矮小,節(jié)間距短,節(jié)數(shù)少,并且在土壤中生長(zhǎng)時(shí)葉片更深綠,葉片小,GmRAV過(guò)量表達(dá)對(duì)莖和葉的發(fā)育以及植株的生長(zhǎng)有推遲抑制作用。轉(zhuǎn)大豆GmRAV基因的煙草植株無(wú)論在長(zhǎng)日照和短日照條件下均表現(xiàn)出開(kāi)花延遲的特征,并且光周期敏感性增強(qiáng),非轉(zhuǎn)基因煙草在長(zhǎng)日照比短日照條件下開(kāi)花提前3天,而GmRAV過(guò)表達(dá)的煙草植株在長(zhǎng)日照比短日照條件下開(kāi)花卻提前13天。7.GmRAV是BR信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑的抑制因子,GmRAV基因通過(guò)抑制BR信號(hào)而抑制植物細(xì)胞伸長(zhǎng)從而抑制生長(zhǎng),導(dǎo)致轉(zhuǎn)基因植株矮化。8.GmRAV是GA生長(zhǎng)信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑中的促進(jìn)因子,是ABA和黑暗促進(jìn)衰老途徑中的促進(jìn)因子。

作者簡(jiǎn)介

  趙琳(1980- ),女,黑龍江省鶴崗市人,博士,助理研究員。主要從事大豆生物技術(shù)研究,2007年至今工作于東北農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)學(xué)院/大豆生物學(xué)省部共建教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室。在利用抑制性消減雜交技術(shù)尋找差異表達(dá)基因、基因克隆、生物信息學(xué)、植物組織培養(yǎng)、轉(zhuǎn)基因及轉(zhuǎn)基因品種培育研究方面取得一定的成績(jī)。

圖書(shū)目錄

1 引言
1.1 植物開(kāi)花機(jī)理的研究進(jìn)展
1.1.1 植物花芽分化過(guò)程的調(diào)節(jié)機(jī)制
1.1.2 環(huán)境條件對(duì)植物成花的調(diào)控
1.2 大豆光周期現(xiàn)象的研究進(jìn)展
1.2.1 大豆生育期性狀的光周期反應(yīng)特性
1.2.2 光周期對(duì)大豆農(nóng)藝性狀和籽粒品質(zhì)的影響
1.2.3 大豆中光敏感性E等位基因的研究進(jìn)展
1.2.4 大豆開(kāi)花時(shí)間基因圖譜的繪制
1.3 擬南芥開(kāi)花誘導(dǎo)的分子生物學(xué)研究進(jìn)展
1.3.1 光周期途徑
1.3.2 春化促進(jìn)途徑
1.3.3 自主途徑
1.3.4 赤霉素途徑
1.3.5 染色質(zhì)結(jié)構(gòu)和開(kāi)花抑制
1.3.6 擬南芥開(kāi)花途徑的整合
1.3.7 植物中的擬南芥開(kāi)花途徑的基因保守性
1.4 植物衰老的研究
1.4.1 衰老的生理生化反應(yīng)特性
1.4.2 衰老學(xué)說(shuō)
1.4.3 衰老的調(diào)控
1.5 RAV轉(zhuǎn)錄因子的研究進(jìn)展
1.6 基因差異表達(dá)的研究方法
1.6.1 基于cDNA的PCR擴(kuò)增方法
1.6.2 基于差減雜交的克隆方法
1.6.3 表達(dá)序列標(biāo)簽
1.6.4 基因表達(dá)系列分析
1.6.5 微陣列雜交
1.6.6 實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)
1.7 植物遺傳轉(zhuǎn)化
1.7.1 植物遺傳轉(zhuǎn)化方法
1.8 研究目的和意義
2 材料和方法
2.1 實(shí)驗(yàn)材料和試劑
2.1.1 植物材料
2.1.2 菌種及載體
2.1.3 主要試劑
2.2實(shí)驗(yàn)方法
2.2.1 抑制性消減雜交(SSH)
2.2.2 抑制消減文庫(kù)的構(gòu)建
2.2.3 反向Northem blot斑點(diǎn)雜交篩選消減文庫(kù)
2.2.4 測(cè)序及序列同源性檢索
2.2.5 實(shí)時(shí)熒光定量PCR進(jìn)一步驗(yàn)證差異表達(dá)的片段
2.2.6 RACE方法克隆大豆GmRAV基因
2.2.7 Real-time RT-PCR分析GmRAV的表達(dá)
2.2.8 植物表達(dá)載體pBI121-GmRAV的構(gòu)建
2.2.9 農(nóng)桿菌介導(dǎo)法轉(zhuǎn)化煙草葉盤(pán)
2.2.10 轉(zhuǎn)基因煙草的分子生物學(xué)檢測(cè)
2.2.11 轉(zhuǎn)GmRAV基因煙草T2代功能分析
3 結(jié)果與分析
3.1 抑制性消減雜交(SSH)
3.1.1 大豆總RNA的提取
3.1.2 SMART技術(shù)合成cDNA
3.1.3 雙鏈cDNA的Rsal酶切結(jié)果
3.1.4 正向差減產(chǎn)物的PCR擴(kuò)增結(jié)果
3.1.5 反向Northern斑點(diǎn)雜交篩選結(jié)果
3.1.6 測(cè)序與同源性檢索結(jié)果
3.1.7 候選cDNA片段差異表達(dá)檢測(cè)分析結(jié)果
3.1.8 基因功能相關(guān)分析
3.2 大豆GmRAV基因克隆
3.2.1 大豆GmRAV基因5'RACE和3'RACE克隆
3.2.2 大豆GmRAV基因全長(zhǎng)序列的生物信息學(xué)及系統(tǒng)進(jìn)化分析
3.2.3 GmRAV全長(zhǎng)基因組DNA序列的獲得
3.3 大豆GmRAV基因表達(dá)研究
3.3.1 大豆葉片中GmRAV基因在LD和SD條件下基因表達(dá)
3.3.2 大豆GmRAV基因在LD和SD條件下組織特異性表達(dá)分析
3.3.3 激素對(duì)大豆葉片中GmRAV基因的表達(dá)影響
3.4 植物表達(dá)載體pBI121-GmRAV的構(gòu)建
3.5 煙草的遺傳轉(zhuǎn)化
3.5.1 叢生芽和根的誘導(dǎo)
3.5.2 轉(zhuǎn)基因煙草的PCR檢測(cè)
3.5.3 轉(zhuǎn)基因煙草的PCR-Southem檢測(cè)
3.5.4 轉(zhuǎn)基因煙草的Nortthem blot檢測(cè)
3.5.5 長(zhǎng)日照和短日照下轉(zhuǎn)基因煙草的T2代表型觀察
3.5.6 轉(zhuǎn)GmRAV基因煙草植株矮化與BR和GA激素有關(guān)
3.5.7 過(guò)量表達(dá)GmRAV增強(qiáng)了ABA促進(jìn)葉片衰老的效應(yīng)
3.5.8 暗處理下GmRAV過(guò)量表達(dá)加速植株的衰老
4 討論
4.1 光周期和衰老相關(guān)基因表達(dá)譜分析
4.2 光周期和衰老相關(guān)基因的克隆
4.3 植物表達(dá)載體的構(gòu)建及煙草的遺傳轉(zhuǎn)化
4.3.1 采用農(nóng)桿菌轉(zhuǎn)化植物的優(yōu)勢(shì)
4.3.2 轉(zhuǎn)化農(nóng)桿菌及其鑒定
4.3.3 用于轉(zhuǎn)化的農(nóng)桿菌的培養(yǎng)
4.3.4 葉盤(pán)法轉(zhuǎn)化煙草
5 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
附錄
攻讀學(xué)位期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文
圖版

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