藥用微生物資源研究技術

第1章 現(xiàn)代藥用微生物資源研究的技術(緒論)
1．1基于培養(yǎng)水平的藥用微生物資源收集技術
1．2基于非培養(yǎng)水平的藥用微生物資源收集技術
1．3生物信息學、芯片技術在藥用微生物研發(fā)中的應用
1．4微生物發(fā)酵產(chǎn)物的生物活性評價技術
1．5微生物天然產(chǎn)物的分離純化與鑒定技術
1．6小結
參考文獻
第2章 微生物菌株的分離
2．1細菌的分離
2．2放線菌的分離
2．3真菌的分離
實驗2．1紅樹林土壤中可培養(yǎng)細菌的分離
實驗2．2紅樹林土壤中鏈霉菌的分離
實驗2．3紅樹林土壤中稀有放線菌的分離
實驗2．4紅樹林海洋真菌的分離
參考文獻
第3章 微生物分類與鑒定
3．1形態(tài)特征
3．2生理生化特征
3．3分子生物學特征
實驗3．1埋片法觀察放線菌個體形態(tài)特征
實驗3．2載片培養(yǎng)法觀察霉菌個體形態(tài)特征
實驗3．3 利用BIOLOG自動化鑒定系統(tǒng)測定微生物對碳源的利用
實驗3．4 16S rRNA序列的獲得及分析
實驗3．5 Tm法測定(G+C)mol％
實驗3．6微孔板DNA雜交
參考文獻
第4章 微生物菌種保藏
4．1斜面低溫保藏法
4．2干燥保藏法
4．3液氮超低溫保藏法
4．4蒸餾水保藏法
4．5甘油(或二甲基亞砜)保藏法
4．6小結
參考文獻
第5章 環(huán)境樣品總DNA的提取與純化
5．1 DNA的提取
5．2 DNA的純化
5．3提取質量的評價
5．4小結
5．5紅樹林土壤DNA的提取與純化的幾種方法
實驗5．5．1 SDS—GITC—PEG法
實驗5．5．2 SDS—GITC—FastPrep—PEG法
實驗5．5．3 Nycodenz法
實驗5．5．4 脈沖凝膠電泳(pulsed field gel electrophmesis，PFGE)膠回收法
參考文獻
第6章 微生物的多樣性分析
6．1 總DNA分析
6．2核酸探針雜交分析技術
6．3基于PCR的多樣性分析技術
6．4 DNA序列分析
6．5組合應用
實驗6．1變性梯度凝膠電泳
參考文獻
第7章 宏基因組技術
7．1 高質量DNA的提取
7．2載體的選擇
7．3宿主的選擇
7．4宏基因組文庫的篩選
7．5宏基因組文庫基因序列的鑒定
7．6小結
實驗7．1紅樹林土壤宏基因組文庫的構建-
參考文獻
第8章 生物芯片
8．1基因芯片
8．2蛋白芯片
8．3芯片實驗室
實驗8．1 構建用于分析自然環(huán)境中硝化和反硝化細菌群落的功能基因芯片
參考文獻
第9章 生物信息學
9．1微生物基因組研究
9．2微生物多樣性
9．3微生物天然產(chǎn)物合成相關功能基因注釋及預測
9．4新型抗生素的開發(fā)
9．5微生物的系統(tǒng)發(fā)育
9．6生物信息學應用實例
實例9．1對一具有抗菌活性陽性克隆子中的插入片段的注釋
實例9．2利用16S rDNA序列構建系統(tǒng)發(fā)育樹
參考文獻
第10章 微生物發(fā)酵技術
10．1概述
10．2微生物的發(fā)酵
10．3發(fā)酵技術基本操作
10．4發(fā)酵機制
10．5抗生素的發(fā)酵機制
10．6發(fā)酵罐操作實例簡介
參考文獻
第11章 微生物天然產(chǎn)物的分離與純化
11．1 概述
11．2微生物天然產(chǎn)物的分離提取
11．3微生物天然產(chǎn)物的純化
實例11．1海洋細菌細胞毒活性代謝產(chǎn)物的分離純化
實例11．2海洋放線菌菌株N350抗腫瘤活性產(chǎn)物的分離純化
實例11．3海洋真菌泡盛酒曲霉細胞毒活性物質的分離純化
參考文獻
第12章 微生物天然產(chǎn)物的結構鑒定
12．1微生物天然產(chǎn)物的結構鑒定的策略
12．2微生物天然產(chǎn)物的結構鑒定方法
參考文獻
第13章 生物活性評價
13．1抗細菌活性檢測與評價
13．2抗真菌活性檢測與評價
13．3抗腫瘤活性藥敏試驗和活性評價
13．4小結
實驗13．1液體培養(yǎng)基稀釋法抗細菌活性測定
實驗13．2 抗白色念珠菌活性檢測
參考文獻